Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF48Q96MX3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms