Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC43Q96MW1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms