Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP57Q96MR6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CFAP57Q96MR6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms