Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf85Q96MD7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms