Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
EP400Q96L91 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EP400Q96L91 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms