Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00208Q96KT6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms