Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPGRIP1Q96KN7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms