Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKNOX2Q96KN3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKNOX2Q96KN3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms