Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SERAC1Q96JX3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms