Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFRP2Q96HF1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFRP2Q96HF1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms