Protein–RNA interactions for Protein: Q96G23

CERS2, Ceramide synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2Q96G23 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS2Q96G23 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS2Q96G23 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS2Q96G23 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS2Q96G23 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS2Q96G23 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS2Q96G23 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS2Q96G23 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CERS2Q96G23 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CERS2Q96G23 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CERS2Q96G23 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CERS2Q96G23 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CERS2Q96G23 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CERS2Q96G23 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CERS2Q96G23 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms