Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMP4Q96G21 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMP4Q96G21 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMP4Q96G21 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMP4Q96G21 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMP4Q96G21 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMP4Q96G21 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMP4Q96G21 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMP4Q96G21 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMP4Q96G21 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMP4Q96G21 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMP4Q96G21 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMP4Q96G21 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMP4Q96G21 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMP4Q96G21 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMP4Q96G21 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMP4Q96G21 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMP4Q96G21 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMP4Q96G21 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP4Q96G21 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms