Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC126Q96EE4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC126Q96EE4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC126Q96EE4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC126Q96EE4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC126Q96EE4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC126Q96EE4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC126Q96EE4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC126Q96EE4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC126Q96EE4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC126Q96EE4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC126Q96EE4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC126Q96EE4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC126Q96EE4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC126Q96EE4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC126Q96EE4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC126Q96EE4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC126Q96EE4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC126Q96EE4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC126Q96EE4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC126Q96EE4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC126Q96EE4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC126Q96EE4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC126Q96EE4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC126Q96EE4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC126Q96EE4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms