Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms