Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EAF2Q96CJ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EAF2Q96CJ1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EAF2Q96CJ1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EAF2Q96CJ1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EAF2Q96CJ1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EAF2Q96CJ1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EAF2Q96CJ1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EAF2Q96CJ1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EAF2Q96CJ1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EAF2Q96CJ1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EAF2Q96CJ1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EAF2Q96CJ1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EAF2Q96CJ1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EAF2Q96CJ1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EAF2Q96CJ1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EAF2Q96CJ1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms