Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEIL2Q969S2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms