Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRF1Q92994 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRF1Q92994 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRF1Q92994 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms