Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDAQ92838 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDAQ92838 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EDAQ92838 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDAQ92838 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDAQ92838 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDAQ92838 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDAQ92838 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDAQ92838 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDAQ92838 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDAQ92838 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDAQ92838 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDAQ92838 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDAQ92838 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDAQ92838 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EDAQ92838 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDAQ92838 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDAQ92838 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDAQ92838 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDAQ92838 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDAQ92838 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDAQ92838 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDAQ92838 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDAQ92838 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDAQ92838 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDAQ92838 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDAQ92838 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDAQ92838 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDAQ92838 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDAQ92838 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDAQ92838 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDAQ92838 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDAQ92838 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDAQ92838 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDAQ92838 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDAQ92838 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDAQ92838 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDAQ92838 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EDAQ92838 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDAQ92838 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDAQ92838 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDAQ92838 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDAQ92838 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDAQ92838 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDAQ92838 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDAQ92838 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDAQ92838 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDAQ92838 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDAQ92838 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDAQ92838 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDAQ92838 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDAQ92838 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDAQ92838 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDAQ92838 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDAQ92838 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDAQ92838 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDAQ92838 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDAQ92838 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDAQ92838 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDAQ92838 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDAQ92838 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDAQ92838 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDAQ92838 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDAQ92838 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDAQ92838 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDAQ92838 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDAQ92838 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDAQ92838 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDAQ92838 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDAQ92838 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDAQ92838 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDAQ92838 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDAQ92838 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDAQ92838 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDAQ92838 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDAQ92838 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDAQ92838 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDAQ92838 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDAQ92838 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDAQ92838 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDAQ92838 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDAQ92838 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDAQ92838 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EDAQ92838 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDAQ92838 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDAQ92838 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDAQ92838 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDAQ92838 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDAQ92838 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDAQ92838 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDAQ92838 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDAQ92838 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDAQ92838 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDAQ92838 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDAQ92838 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDAQ92838 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDAQ92838 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDAQ92838 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDAQ92838 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDAQ92838 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms