Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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RABGGTAQ92696 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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RABGGTAQ92696 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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