Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCSTNQ92542 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NCSTNQ92542 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms