Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms