Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
C7orf43Q8WVR3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.57■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.56■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.55■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.54■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.54■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.53■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.52■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
C7orf43Q8WVR3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms