Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms