Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA4Q8NEY3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA4Q8NEY3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms