Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms