Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FSIP1Q8NA03 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms