Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC89Q8N998 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms