Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAF1Q8N7H5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms