Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCML4Q8N228 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCML4Q8N228 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCML4Q8N228 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCML4Q8N228 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCML4Q8N228 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms