Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
GJD3Q8N144 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms