Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR4Q8IZ21 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR4Q8IZ21 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR4Q8IZ21 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR4Q8IZ21 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR4Q8IZ21 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR4Q8IZ21 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR4Q8IZ21 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR4Q8IZ21 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR4Q8IZ21 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR4Q8IZ21 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR4Q8IZ21 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR4Q8IZ21 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHACTR4Q8IZ21 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHACTR4Q8IZ21 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHACTR4Q8IZ21 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHACTR4Q8IZ21 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms