Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAP2Q8IXW5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RPAP2Q8IXW5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms