Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC3Q8IVU1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms