Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A9Q8IVB4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A9Q8IVB4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms