Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3FQ8IUX4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms