Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
VSIG1Q86XK7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSIG1Q86XK7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms