Protein–RNA interactions for Protein: Q86WR0

CCDC25, Coiled-coil domain-containing protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25Q86WR0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC25Q86WR0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC25Q86WR0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC25Q86WR0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC25Q86WR0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC25Q86WR0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC25Q86WR0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC25Q86WR0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC25Q86WR0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC25Q86WR0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC25Q86WR0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC25Q86WR0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms