Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms