Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PBRM1Q86U86 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PBRM1Q86U86 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PBRM1Q86U86 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms