Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD3Q7Z3D4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms