Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEGR1Q7Z3B1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms