Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CATSPER4Q7RTX7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms