Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF23Q7RTU1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF23Q7RTU1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF23Q7RTU1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF23Q7RTU1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF23Q7RTU1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF23Q7RTU1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF23Q7RTU1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF23Q7RTU1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF23Q7RTU1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF23Q7RTU1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF23Q7RTU1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF23Q7RTU1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF23Q7RTU1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF23Q7RTU1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF23Q7RTU1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF23Q7RTU1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF23Q7RTU1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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