Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HS2ST1Q7LGA3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms