Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.265e-6■■■■□ 22.5
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SND1Q7KZF4 MUC4-203ENST00000346145 3982 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.35e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 HEXA-214ENST00000569116 449 ntTSL 212.89□□□□□ -0.358e-10■■■■□ 22.5
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SND1Q7KZF4 MUC4-204ENST00000349607 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.415e-6■■■■□ 22.5
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SND1Q7KZF4 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.465e-6■■■■□ 22.5
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SND1Q7KZF4 TPD52L1-204ENST00000392482 1165 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.575e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 ATF3-206ENST00000366987 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.665e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 SPAG5-215ENST00000582175 657 ntTSL 510.94□□□□□ -0.665e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 PREPL-202ENST00000378511 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.675e-6■■■■□ 22.5
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SND1Q7KZF4 PREPL-204ENST00000409272 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.885e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 COPB1-210ENST00000533533 537 ntTSL 48.97□□□□□ -0.975e-6■■■■□ 22.5
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SND1Q7KZF4 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -15e-6■■■■□ 22.5
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SND1Q7KZF4 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.085e-6■■■■□ 22.5
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SND1Q7KZF4 ATF3-205ENST00000366985 516 ntTSL 57.98□□□□□ -1.135e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 MUC4-218ENST00000478156 16562 ntTSL 57.79□□□□□ -1.165e-6■■■■□ 22.5
SND1Q7KZF4 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.225e-6■■■■□ 22.5
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SND1Q7KZF4 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.275e-6■■■■□ 22.5
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SND1Q7KZF4 MUC4-208ENST00000462323 16197 ntTSL 56.35□□□□□ -1.395e-6■■■■□ 22.5
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SND1Q7KZF4 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.485e-6■■■■□ 22.5
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SND1Q7KZF4 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.65e-6■■■■□ 22.5
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SND1Q7KZF4 PREPL-211ENST00000426481 6273 ntTSL 1 (best)4.42□□□□□ -1.75e-6■■■■□ 22.5
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SND1Q7KZF4 RPN1-204ENST00000481168 751 ntTSL 213.23□□□□□ -0.293e-11■■■■□ 22.4
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SND1Q7KZF4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.392e-7■■■■□ 22.4
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SND1Q7KZF4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.372e-7■■■■□ 22.4
SND1Q7KZF4 TMEM147-209ENST00000599895 1045 ntTSL 516.76■□□□□ 0.272e-7■■■■□ 22.4
SND1Q7KZF4 RCN3-204ENST00000597801 549 ntTSL 520.38■□□□□ 0.852e-7■■■■□ 22.4
SND1Q7KZF4 RCN3-203ENST00000593644 223 ntTSL 312.81□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 22.4
SND1Q7KZF4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.021e-6■■■■□ 22.3
SND1Q7KZF4 ARL6IP5-203ENST00000478935 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.661e-7■■■■□ 22.3
SND1Q7KZF4 ARL6IP5-201ENST00000273258 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.951e-7■■■■□ 22.3
SND1Q7KZF4 P3H1-203ENST00000372526 654 ntTSL 318.64■□□□□ 0.575e-8■■■■□ 22.3
SND1Q7KZF4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.021e-7■■■■□ 22.3
SND1Q7KZF4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.971e-7■■■■□ 22.3
SND1Q7KZF4 PLLP-202ENST00000564018 449 ntTSL 517.41■□□□□ 0.381e-7■■■■□ 22.3
SND1Q7KZF4 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.131e-7■■■■□ 22.3
SND1Q7KZF4 SRGN-201ENST00000242465 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.618e-12■■■■□ 22.3
SND1Q7KZF4 SRGN-202ENST00000462445 802 ntTSL 28.34□□□□□ -1.078e-12■■■■□ 22.3
SND1Q7KZF4 LGMN-210ENST00000555169 543 ntTSL 217.56■□□□□ 0.43e-7■■■■□ 22.3
SND1Q7KZF4 APP-217ENST00000548570 361 ntTSL 25.14□□□□□ -1.596e-17■■■■□ 22.3
SND1Q7KZF4 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.097e-9■■■■□ 22.3
SND1Q7KZF4 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.097e-9■■■■□ 22.3
SND1Q7KZF4 ATF6B-216ENST00000494022 320 ntTSL 212.83□□□□□ -0.367e-9■■■■□ 22.3
SND1Q7KZF4 ATF6B-211ENST00000453203 425 ntTSL 512.59□□□□□ -0.397e-9■■■■□ 22.3
SND1Q7KZF4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.544e-7■■■■□ 22.3
SND1Q7KZF4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.244e-7■■■■□ 22.3
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