Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFXL1Q6ZNB6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFXL1Q6ZNB6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms