Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN03

LINC00322, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00322, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00322Q6ZN03 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC00322Q6ZN03 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00322Q6ZN03 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00322Q6ZN03 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00322Q6ZN03 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00322Q6ZN03 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00322Q6ZN03 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00322Q6ZN03 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00322Q6ZN03 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00322Q6ZN03 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms