Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MUC6Q6W4X9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MUC6Q6W4X9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms