Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINGO4Q6UY18 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms