Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWM7

LCTL, Lactase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCTLQ6UWM7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LCTLQ6UWM7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCTLQ6UWM7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms